En el Doctorado en Ingeniería de Sistemas (DIS) se realiza investigación con un abordaje inter, multi y transdisciplinario, cuyos resultados inciden en el bienestar de la sociedad y se transfieren a los diferentes sectores de la sociedad. Se promueve la generación de conocimiento científico y su transformación en innovaciones útiles para la sociedad a través de proyectos de investigación en los que participan los estudiantes del programa, ya sea a través de su proyecto de tesis o a través del Programa Institucional de Formación de Investigadores (BEIFI). Asimismo, se acompaña a los para que generen productos científicos derivados de su trabajo de investigación, tales como publicación de artículos científicos en revistas indizadas en JCR, WOS, SCOPUS y Conacyt, capítulos de libro en editoriales de prestigio nacional e internacional como Springer, así como modelos de utilidad y patentes por programas de software y patentes.
La productividad científica de los miembros del núcleo académico (NA) del DIS se transfiere a los sectores a través de artículos científicos, participación en congresos nacionales e internacionales, capítulos de libros, proyectos de tesis, patentes y modelos de utilidad, entre otros. Los estudiantes participan de manera proactiva a la aportación al estado del arte. En el periodo 2017-2021, la productividad del programa sumó 783 productos, de los cuales 469 son artículos científicos publicados en revistas indizadas (en JCR, WOS, SCOPUS y Conacyt), 78 tesis dirigidas y 17 en proceso, 131 participaciones en congresos nacionales e internacionales, 77 capítulos de libro publicados en editoriales de prestigio y, finalmente, 3 solicitudes de patente. Cabe aclarar en el caso de artículos publicados, en varios artículos están como coautores dos o más profesores del NA y uno o varios estudiantes; lo mismos sucede en los casos de capítulos de libro publicados, en trabajos presentados en congresos y las patentes solicitadas.
La mayor productividad corresponde a artículos científicos (59.89 % de la total), seguida por los congresos nacionales e internacionales (16.73 %), tesis (12.13 %) y capítulos de libro (9.83 %). De 2017 a 2021, el NA ha puesto especial interés en el aspecto de registro de patentes y modelos de utilidad, lo que ha resultado en la solicitud de 3 patentes. Del total de los 783 productos reportados en el periodo 2017-2021, en más del 50 % (es decir, más de 392 productos) han participado los estudiantes. Los productos comprenden la mayor parte de los estudios que se han diseñado y emprendido por estudiantes y profesores para el desarrollo del programa. La productividad académica del DIS está alineada con sus tres Líneas de Generación y/o Aplicación del Conocimiento (LGAC), contribuyendo al logro del perfil de egreso.
Debido a que en este proceso son fundamentales las unidades de patentamiento y de transferencia de tecnología en el Instituto Politécnico Nacional (IPN), la Dirección de Servicios Empresariales y Transferencia Tecnológica y la Dirección de Prospectiva e Inteligencia Tecnológica Tecnópoli se encargan de gestionar la vinculación entre el sector empresarial y el académico; en la normatividad institucional se han establecido los mecanismos para la transferencia de conocimiento.